Основной задачей при наладке аэротенка является накопление необходимого объёма активного ила. Его можно приготовить непосредственно в самом сооружении из сточной жидкости. Для этого воду, попавшую из первичного отстойника, нужно продуть обычным воздухом. На 1 кубометр жидкости воздуха необходимо 5-6. Такое приготовление возможно в аэротенке, загруженном не более чем наполовину.

Ил, произведённый вторичным отстойником и перекачанный в аэротенк, подвергается воздушной продувке без подачи сточной жидкости. Делается это до тех пор, пока не появятся в осадке нитраты и растворённый кислород, а также не исчезнет аммонийный азот. Активный ил образуется в течение месяца. Аэротенк вводится в эксплуатацию, заполняясь сточной жидкостью в объёме, соответствующем количеству активного ила в нём. На расчётную нагрузку сооружение выводится после набора расчётного же объёма активного материала.

Повышенную активность продувкой в аэротенке можно придать также илу, взятому из вторичного отстойника, установленному за биофильтром.

Установка биологической очистки сточных вод должна аэрироваться в обязательном порядке равномерно. Величина расхода воздуха определяется содержанием в сточной воде органических примесей. Подача должна быть непрерывной.

Объём воздуха, подаваемого в очистное сооружение, будет определяться такими параметрами, как требуемое качество очищения канализационных вод, насыщенность жидкости растворённым кислородом, концентрация активного ила. При снижении указанных величин подача воздуха нужно увеличивать. Регулирование одних параметров возможно и за счёт изменения других. Например: повышение концентрации активного ила увеличивает качество очистки воды и содержание растворённого кислорода в ней.

Важно поддерживать концентрацию в нормальных пределах – 2-3 г/л. Величина рассчитывается по веществу сухому. Дефицит должен восполняться, а избыток – убираться.